Гостро критикувалися й самі газети, насамперед ті з них, які намагалися зайняти більш помірковану позицію щодо заготівель. Наприклад, «Правда Украины» від 6 жовтня 1946 р. в статті «Політична короткозорість» критикувала обласну газету «Червоне Запоріжжя», яка, з точки зору авторів публікації,«не зробила навіть слабкої спроби присікти саботаж хлібозаготівель», «стати на захист державних інтересів», домогтися «суворого покарання для розкрадачів зерна, злісних порушників закону про хлібозаготівлі».
Взагалі з публікацій періодичної преси того часу можна зробити висновок про величезну напругу, в якій проходили заготівлі 1946 р. Причому, чим очевиднішим ставав той факт, що республіка не зможе виконати поставлене перед нею завдання навіть наполовину, тим різкішим і загрозливішим ставав тон публікацій. Не рахуючись із станом справ, що склався в сільському господарстві республіки, преса закликала «наполегливо боротися за кожен пуд хліба — все, що може бути здано державі,— повинно бути здано».
В ході розгортання хлібозаготівель посилювався тиск центральних союзних органів на керівництво республіки. Так, міністр заготівель СРСР у телеграмі від 4 листопада 1946 р. на ім'я Хрущова дав вказівку перевірити особисті рахунки колгоспів і радгоспів. До всіх господарств, які не забезпечили виконання плану, «пред'явити жорсткі вимоги», «винних у навмисній затримці здачі продкультур притягти до суворої відповідальності».
До жовтня 1946 р. Рада Міністрів УРСР та ЦК КП(б)У прийняли понад 10 постанов, що стосувалися хлібозаготівель. В них ставилася вимога повного виконання планів, а затримка здачі товарного хліба була оголошена «злочином перед партією і державою». Ці постанови закликали також переглянути склад уповноважених і тих, хто не забезпечує виконання доручених завдань, відкликати, «замінивши їх політично грамотними кадрами, які розуміють особливості хлібозаготівель в умовах цього року і спроможні на ділі забезпечити виконання покладених на них завдань». Вимагалося провести повторну перевірку колгоспів, радгоспів та індивідуальних господарств, вилучити все зерно, засипане в які б то не було фонди, крім насіння з ярих насіннєвих ділянок.
Посилення опору хлібозаготівлям вело, в свою чергу, до посилення репресій проти керівників господарств. Як писав радянський історик І. М. Волков, «ніколи в минулому в історії колгоспного будівництва зміна голів колгоспів не досягала таких масштабів, як у 1946 і 1947 роках». Причому їх не тільки знімали з посад, але нерідко притягали й до судової відповідальності., За даними Міністерства юстиції УРСР, протягом 1946 р. і 1-го кварталу 1947 р. судові органи республіки розглянули 1681 справу про злочин цієї категорії керівників. Фактично засуджений був кожен шістнадцятий з 26 745 голів колгоспів республіки. Сісти на лаву підсудних можна було за найменшу провину чи помилку, а то й зовсім безвинно. Так, 7 років ув'язнення одержав голова колгоспу «Червоний котовець» Роздільнянського району Одеської області лише за те, що видав колгоспникам як аванс зерно, намолочене в перші дні збирання, ще не здавши в той час нічого державі. За подібний «злочин» був відданий під суд і голова колгоспу ім. Чапаєва, що на Ворошиловградщині. До 4 років таборів була засуджена Хабарова — голова колгоспу ім. 1 Травня на Миколаївщині лише за те, що намагалася утаїти під виглядом відходів 350 ц зерна.
Часто на лаву підсудних потрапляли вчорашні солдати, інваліди війни, які після повернення додому встигли попрацювати на посаді керівників господарств лише декілька місяців. Як визнавав заступник Голови Верховного Суду УРСР Сусло, «випадки притягування до кримінальної відповідальності . нових голів колгоспів (які ще не мали досвіду, зайнявши цю посаду після війни) за перші ж помилки в роботі були непоодинокі». Із загальної кількості голів колгоспів, притягнутих до кримінальної відповідальності за 1946 р. і 1-й квартал 1947 р., 30,4 % працювали на цій посаді від 1 до 2 років, 20,7 % — до 6 місяців, 34,5 % — до 1 року і тільки 14,4 % — понад 2 роки. При цьому учасники Великої Вітчизняної війни, інваліди становили серед них 70,4 %. В основному їх засуджували за порушення графіка виконання хлібопоставок, витрачання більш як 15 % від зданого державі зерна на внутрішньогосподарські проблеми, зрив хлібозбиральної кампанії. Ініціатива в порушенні такого роду судових справ часто виходила від місцевих керівників, які нерідко порушували наказ Генерального прокурора СРСР про те, що голова колгоспу міг бути притягнутий до кримінальної відповідальності тільки із санкції обласного прокурора. Цей наказ мав на меті в умовах найгострішого дефіциту кадрів хоч якоюсь мірою захистити голів колгоспів від свавілля місцевого керівництва.
У зв'язку з серйозним опором голів колгоспів, селян проведенню хлібозаготівель про цей наказ швидко забули. Хвиля репресій продовжувала наростати. І вже в грудні 1946 р. Прокурор УРСР дав вказівку низовим органам прокуратури активізувати боротьбу з фактами розбазарювання та розтягання зерна, саботажу хлібозаготівель. Вироки судів ставали дедалі жорсткішими. За розбазарювання 73 ц зерна і 387 ц борошна (а під цим терміном розуміли тоді видачу продукції на трудодні, витрати на внутрішньогосподарські потреби) до 7 років ув'язнення був засуджений голова колгоспу ім. Стаханова Червоноармійського району Сталінської області Ковальов. За приховування 360 ц зерна і саботаж хлібозаготівель до 10 років був засуджений голова колгоспу ім. Шевченка Чернігівської області Петриченко, 8 років отримав комірник цього ж колгоспу. Особливо старалися суди Київської, Кам'янець-Подільської (нині—Хмельницької), Чернігівської, Ворошиловградської, Одеської та Сталінської областей. Основним видом «злочинів» лишалися господарські дії, пов'язані з невиконанням державних зобов'язань.
Зростала кількість осіб, засуджених за розбазарювання та крадіжки хліба. Якщо в жовтні за це було притягнуто до відповідальності 997 чоловік, то в листопаді — уже 2313. В ряді областей були проведені показові судові процеси.
Незважаючи на посилення репресій наприкінці 1946— на початку 1947 рр., план хлібозаготівель республіка виконала приблизно лише на 60 %, здавши при цьому фактично все вирощене зерно, включаючи насіннєві фонди. Намагаючись виправити становище, Політбюро ЦК КП(б)У у листопаді — грудні 1946 р. щотижня розглядало питання про хід хлібозаготівель. В ряд областей України для «подання допомоги» місцевим партійним і радянським органам у проведенні цієї кампанії були знову направлені відповідальні працівники. Газети вимагали «повернути в колгоспи всіх уповноважених, попередивши, що не тільки за бездіяльність, а й за недостатню активність по захисту інтересів партії і держави їх буде покарано».
На основі постанов Ради Міністрів СРСР від ЗО листопада 1946 р. та Ради Міністрів УРСР від 2 грудня «Про здачу хліба підсобними господарствами» в республіці була організована повторна перевірка наявності хліба в підсобних господарствах підприємств та організацій з метою вилучення хліба. Однак ні в підсобних господарствах, ні в колгоспах більше не було чого віддавати, про що керівництво республіки повідомляло в Москву. Ще 15 жовтня 1946 р. Хрущов у листі до Сталіна звертав його увагу на те, що «посуха, яка мала місце на Україні цього року, знизила врожайність хлібів наполовину проти попередніх оцінок», внаслідок чого «валовий збір зернових культур по колгоспах зменшився проти попередніх оцінок на 310 млн. пудів. Те ж саме з картоплею і цукровими буряками». Але Сталін вважав інакше. 26 листопада 1946 р. за його та Жданова підписами в республіки були направлені телеграми з вимогою «покінчити з небільшовицьким ставленням до справи організації хлібозаготівель і забезпечити виконання плану».